Após a extinção do Palmeiras Esporte Clube, sentiu-se falta de um clube de futebol na cidade de Mineiros, em Goiás. Assim foi fundado o Mineiros Esporte Clube, no dia 20 de janeiro de 1977.
Em seu primeiro ano, disputou o Campeonato Goiano, mas acabou na lanterna da competição. Nos anos seguinte, foram campanhas regulares até o seu rebaixamento para a Segunda Divisão em 1979.
Disputa a Segunda Divisão até 1984, quando licencia-se. Retorna em 1987 ficando com a quarta colocação. Em 1988 conquista o Vice da Segundona e o acesso a Elite do Futebol Goiano.
Em 1990, com boas campanhas no primeiro e segundo turno, o clube chega ao vice campeonato goiano. Entre 1994 e 2002 foi mais um período licenciado.
Em seu retorno, em 2003, pela Terceira Divisão, o clube conquista o campeonato e o acesso. Em 2004, novo acesso, e novo título, agora da Segunda Divisão.
Em seu retorno a Primeira Divisão, em 2005, o clube chega a histórica 3ª colocação, garantindo vaga na Série C do Campeonato Brasileiro do mesmo ano ficando na 34ª colocação e a Copa do Brasil de 2006, que o clube acabou sendo eliminado na Segunda Fase pelo Atlético Mineiro.
O clube obteve campanhas regulares entre 2006 a 2009, quando foi novamente rebaixado. Várias tentativas de novo acesso, chegando perto em 2010 e 2011 com a 3ª colocação.
Em 2014 o clube teve problemas para a disputa da Segunda Divisão, melhorias exigidas pelos órgãos de segurança foram orçadas em 60 mil reais, verba que o clube não tinha. A solução veio de Aparecida de Goiânia, a prefeitura dessa cidade cedeu ao clube o estádio Municipal Aníbal Teixeira, sem qualquer ônus para o clube, assim o clube pode disputar a competição.
No ano de 2015, o clube desiste de disputar a Segunda Divisão, com isso o clube fica suspenso por dois anos.
Em 2017, o clube retorna, agora pela Terceira Divisão, ficando em 7º lugar. Em 2018 o clube fica com a 6ª colocação.
Retrospecto do clube na Primeira Divisão:
1977 - 10º
1978 - 11º
1979 - 8º (Rebaixado)
1989 - 11º
1990 - 2º
1991 - 6º
1992 - 9º
1993 - 3º
1994 - Licenciado
2005 - 3º
2006 - 6º
2007 - 6º
2008 - 7º
2009 - 9º (Rebaixado)
Retrospecto do clube na Segunda Divisão:
1980 - ??
1981 - ??
1982 - ??
1983 - ??
1984 - ??
1985 - Licenciado
1986 - Licenciado
1987 - 4º
1988 - 2º (Promovido)
1995-2001 - Licenciado
2004 - 1º (Promovido)
2010 - 3º
2011 - 3º
2012 - 4º
2013 - 8º
2014 - 9º
2015 - Licenciado
Retrospecto do clube na Terceira Divisão:
2002 - Licenciado
2003 - 1º (Promovido)
2016 - Licenciado
2017 - 7º
2018 - 6º
Fonte: Globo Esporte/ FGF.esp.br/ Jornal Esportivo/ Futebol de Goyaz/ 1 Time Por Dia/ Futebol Nacional/ RSSSF Brasil
